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藤新一是天下驰誉的高中生侦查,在一次追究黑衣人建功团伙时行运被团伙成员制作,击晕后喂了奇妙的药水,工藤新一变回了孩子!新一找到了素日帮忙他的阿笠博士,博士为他度身打造无数奸细兵器。为了避免建功团伙对他结束报恩,新一筛选抛头露面,背地追究他们,祈望能失去解药。一日,新一的女友毛利兰来到了阿笠博士的家查找男友的着落,被小兰撞见的新一情急之下伪造了本人名叫江户川柯南,随后柯南旅居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦查,新一可以或许籍着和他一同四出办案一同追究黑夜人的着落。柯南在小学意识步美等小学生,他们一同组织了一个青年侦查对,向罪犯宣战!