故事从97年《最终幻想VII》终局两年尔后劈头,当人们感到天下都是
战争之时,所谓的“星痕症候群”的病却劈头四周伸张,天下再度面对危殆。并且基本上为救护天下而战的英豪克劳德却与世隔绝伶仃的生在世……
剧情叙说配角们打垮赛菲罗斯(Sephiroth),救护星球免于宏大陨石的侵袭后两年,神奇的怪病「星痕症候群」在各地连续传出病例。而配角克劳德(Cloud)在与爱莉斯(Aerith)死别后,便闷闷不乐。某日忽然泛起了与赛菲罗斯有
未知关连的神奇3人组,除了直接对克劳德构成要挟以外,还进行着一连串潜藏的规划,将已回归各自生活的配角群们,再次的卷入风云中…… 此版为2009年从新建造及追加了近30分钟的完备版本。