在参拜母亲宅兆的回程途中,真嗣(绪方惠美 配音)和葛城美里(三石琴乃 配音)遭受了第七使徒的打击,症结时辰2号机秋风扫落叶挫败敌手,真嗣也由此结识了2号机的操纵者式波·明日香·兰格蕾(宫村优子 配音)。与大言不惭的绫波丽(林原惠美 配音)差别,明日香自负
宣扬,以致有些自卑,在和真嗣相处的生计里,互相闹出不少的笑话。他们三人分离驾驶着零号机、初号机和2号机,抵制了第八使徒激烈的打击,在这一过程当中,淡淡的情愫悄悄在这三个少年男女人心中萌发。未几后,第九、十使徒接踵光降,真嗣他们面对着生与死的严峻磨难…… 本片为福音兵士新剧院版四部曲第二部。